Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
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