Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP1A4Q13733 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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