Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1orf61Q13536 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms