Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
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