Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRSQ13332 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms