Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SCGB2A2Q13296 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SCGB2A2Q13296 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SCGB2A2Q13296 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SCGB2A2Q13296 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SCGB2A2Q13296 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SCGB2A2Q13296 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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SCGB2A2Q13296 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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SCGB2A2Q13296 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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SCGB2A2Q13296 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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