Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPA4Q13156 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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