Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSTF3Q12996 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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