Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSPB3Q12988 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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