Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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