Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TROQ12816 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TROQ12816 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TROQ12816 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TROQ12816 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TROQ12816 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TROQ12816 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TROQ12816 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TROQ12816 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TROQ12816 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TROQ12816 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TROQ12816 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TROQ12816 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TROQ12816 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TROQ12816 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TROQ12816 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TROQ12816 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TROQ12816 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TROQ12816 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TROQ12816 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TROQ12816 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TROQ12816 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TROQ12816 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TROQ12816 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TROQ12816 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TROQ12816 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TROQ12816 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TROQ12816 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TROQ12816 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TROQ12816 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TROQ12816 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TROQ12816 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TROQ12816 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TROQ12816 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TROQ12816 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TROQ12816 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TROQ12816 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TROQ12816 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TROQ12816 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TROQ12816 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TROQ12816 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TROQ12816 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TROQ12816 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TROQ12816 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TROQ12816 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TROQ12816 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TROQ12816 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TROQ12816 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TROQ12816 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TROQ12816 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TROQ12816 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TROQ12816 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TROQ12816 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TROQ12816 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TROQ12816 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TROQ12816 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TROQ12816 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TROQ12816 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TROQ12816 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TROQ12816 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TROQ12816 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TROQ12816 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TROQ12816 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TROQ12816 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TROQ12816 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TROQ12816 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TROQ12816 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TROQ12816 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TROQ12816 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TROQ12816 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TROQ12816 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TROQ12816 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TROQ12816 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TROQ12816 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TROQ12816 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TROQ12816 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TROQ12816 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TROQ12816 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TROQ12816 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TROQ12816 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TROQ12816 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TROQ12816 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TROQ12816 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TROQ12816 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TROQ12816 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TROQ12816 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TROQ12816 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TROQ12816 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TROQ12816 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TROQ12816 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TROQ12816 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TROQ12816 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TROQ12816 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TROQ12816 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TROQ12816 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TROQ12816 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TROQ12816 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TROQ12816 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TROQ12816 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TROQ12816 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms