Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXO1Q12778 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms