Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCC8Q09428 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms