Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PAX8Q06710 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms