Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RAD51Q06609 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RAD51Q06609 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms