Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRKCDQ05655 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms