Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms