Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACVR1Q04771 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACVR1Q04771 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms