Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms