Protein–RNA interactions for Protein: Q01814

ATP2B2, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B2Q01814 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP2B2Q01814 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP2B2Q01814 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP2B2Q01814 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP2B2Q01814 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP2B2Q01814 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP2B2Q01814 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP2B2Q01814 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP2B2Q01814 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP2B2Q01814 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP2B2Q01814 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP2B2Q01814 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP2B2Q01814 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP2B2Q01814 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP2B2Q01814 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP2B2Q01814 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP2B2Q01814 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP2B2Q01814 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP2B2Q01814 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP2B2Q01814 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP2B2Q01814 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP2B2Q01814 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP2B2Q01814 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP2B2Q01814 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP2B2Q01814 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP2B2Q01814 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP2B2Q01814 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP2B2Q01814 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP2B2Q01814 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP2B2Q01814 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP2B2Q01814 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP2B2Q01814 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP2B2Q01814 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP2B2Q01814 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP2B2Q01814 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP2B2Q01814 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP2B2Q01814 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP2B2Q01814 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP2B2Q01814 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP2B2Q01814 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP2B2Q01814 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP2B2Q01814 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP2B2Q01814 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP2B2Q01814 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms