Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRF9Q00978 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms