Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK6Q00534 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms