Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERVS71-1P61550 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms