Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP107P57740 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP107P57740 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP107P57740 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP107P57740 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP107P57740 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP107P57740 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP107P57740 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUP107P57740 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUP107P57740 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUP107P57740 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NUP107P57740 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUP107P57740 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUP107P57740 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUP107P57740 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUP107P57740 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUP107P57740 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUP107P57740 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUP107P57740 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUP107P57740 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUP107P57740 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUP107P57740 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NUP107P57740 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP107P57740 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP107P57740 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP107P57740 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP107P57740 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP107P57740 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP107P57740 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP107P57740 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP107P57740 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP107P57740 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP107P57740 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP107P57740 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP107P57740 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP107P57740 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP107P57740 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP107P57740 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP107P57740 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP107P57740 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP107P57740 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP107P57740 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP107P57740 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP107P57740 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP107P57740 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP107P57740 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP107P57740 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP107P57740 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP107P57740 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP107P57740 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP107P57740 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP107P57740 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP107P57740 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP107P57740 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NUP107P57740 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NUP107P57740 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms