Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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RIPPLY3P57055 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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RIPPLY3P57055 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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RIPPLY3P57055 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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RIPPLY3P57055 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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RIPPLY3P57055 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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RIPPLY3P57055 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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RIPPLY3P57055 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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RIPPLY3P57055 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RIPPLY3P57055 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY3P57055 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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