Protein–RNA interactions for Protein: P55157

MTTP, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTTPP55157 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTTPP55157 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTTPP55157 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTTPP55157 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTTPP55157 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MTTPP55157 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTTPP55157 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTTPP55157 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTTPP55157 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTTPP55157 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTTPP55157 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTTPP55157 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTTPP55157 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTTPP55157 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTTPP55157 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTTPP55157 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTTPP55157 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTTPP55157 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MTTPP55157 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTTPP55157 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTTPP55157 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MTTPP55157 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTTPP55157 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTTPP55157 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTTPP55157 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTTPP55157 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTTPP55157 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MTTPP55157 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTTPP55157 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTTPP55157 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTTPP55157 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTTPP55157 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTTPP55157 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTTPP55157 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTTPP55157 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTTPP55157 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTTPP55157 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTTPP55157 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTTPP55157 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTTPP55157 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MTTPP55157 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MTTPP55157 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MTTPP55157 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MTTPP55157 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTTPP55157 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTTPP55157 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTTPP55157 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTTPP55157 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTTPP55157 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MTTPP55157 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTTPP55157 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTTPP55157 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTTPP55157 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTTPP55157 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTTPP55157 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTTPP55157 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTTPP55157 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTTPP55157 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTTPP55157 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTTPP55157 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTTPP55157 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTTPP55157 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTTPP55157 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTTPP55157 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTTPP55157 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTTPP55157 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTTPP55157 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTTPP55157 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTTPP55157 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTTPP55157 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTTPP55157 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTTPP55157 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTTPP55157 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTTPP55157 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTTPP55157 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTTPP55157 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTTPP55157 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTTPP55157 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTTPP55157 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTTPP55157 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTTPP55157 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTTPP55157 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTTPP55157 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MTTPP55157 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTTPP55157 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTTPP55157 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTTPP55157 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTTPP55157 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTTPP55157 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MTTPP55157 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MTTPP55157 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTTPP55157 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MTTPP55157 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTTPP55157 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTTPP55157 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTTPP55157 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTTPP55157 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTTPP55157 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTTPP55157 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MTTPP55157 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms