Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GBX2P52951 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GBX2P52951 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GBX2P52951 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GBX2P52951 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GBX2P52951 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GBX2P52951 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GBX2P52951 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GBX2P52951 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GBX2P52951 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GBX2P52951 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
GBX2P52951 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBX2P52951 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBX2P52951 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBX2P52951 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBX2P52951 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBX2P52951 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBX2P52951 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBX2P52951 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBX2P52951 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBX2P52951 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBX2P52951 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBX2P52951 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBX2P52951 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBX2P52951 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBX2P52951 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBX2P52951 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBX2P52951 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBX2P52951 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBX2P52951 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBX2P52951 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBX2P52951 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBX2P52951 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBX2P52951 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBX2P52951 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBX2P52951 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBX2P52951 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBX2P52951 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GBX2P52951 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GBX2P52951 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBX2P52951 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBX2P52951 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBX2P52951 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBX2P52951 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GBX2P52951 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GBX2P52951 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GBX2P52951 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBX2P52951 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBX2P52951 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBX2P52951 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBX2P52951 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBX2P52951 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBX2P52951 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GBX2P52951 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBX2P52951 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBX2P52951 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBX2P52951 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBX2P52951 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBX2P52951 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GBX2P52951 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBX2P52951 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBX2P52951 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBX2P52951 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBX2P52951 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBX2P52951 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBX2P52951 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBX2P52951 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBX2P52951 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBX2P52951 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBX2P52951 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBX2P52951 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBX2P52951 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBX2P52951 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GBX2P52951 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBX2P52951 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBX2P52951 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBX2P52951 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBX2P52951 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBX2P52951 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GBX2P52951 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBX2P52951 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GBX2P52951 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBX2P52951 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBX2P52951 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GBX2P52951 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBX2P52951 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBX2P52951 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBX2P52951 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBX2P52951 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GBX2P52951 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GBX2P52951 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GBX2P52951 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBX2P52951 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBX2P52951 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBX2P52951 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBX2P52951 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBX2P52951 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBX2P52951 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBX2P52951 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GBX2P52951 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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