Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
THOP1P52888 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
THOP1P52888 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
THOP1P52888 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
THOP1P52888 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
THOP1P52888 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
THOP1P52888 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
THOP1P52888 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
THOP1P52888 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
THOP1P52888 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
THOP1P52888 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
THOP1P52888 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
THOP1P52888 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
THOP1P52888 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
THOP1P52888 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
THOP1P52888 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
THOP1P52888 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
THOP1P52888 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
THOP1P52888 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
THOP1P52888 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
THOP1P52888 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
THOP1P52888 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
THOP1P52888 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
THOP1P52888 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
THOP1P52888 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
THOP1P52888 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
THOP1P52888 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
THOP1P52888 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
THOP1P52888 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
THOP1P52888 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
THOP1P52888 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
THOP1P52888 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
THOP1P52888 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
THOP1P52888 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
THOP1P52888 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
THOP1P52888 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
THOP1P52888 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
THOP1P52888 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
THOP1P52888 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
THOP1P52888 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
THOP1P52888 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
THOP1P52888 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
THOP1P52888 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
THOP1P52888 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
THOP1P52888 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
THOP1P52888 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
THOP1P52888 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
THOP1P52888 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
THOP1P52888 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
THOP1P52888 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
THOP1P52888 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
THOP1P52888 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
THOP1P52888 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
THOP1P52888 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
THOP1P52888 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
THOP1P52888 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
THOP1P52888 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
THOP1P52888 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
THOP1P52888 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
THOP1P52888 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
THOP1P52888 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
THOP1P52888 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
THOP1P52888 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
THOP1P52888 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
THOP1P52888 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
THOP1P52888 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
THOP1P52888 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
THOP1P52888 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
THOP1P52888 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
THOP1P52888 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
THOP1P52888 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
THOP1P52888 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
THOP1P52888 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
THOP1P52888 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
THOP1P52888 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
THOP1P52888 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
THOP1P52888 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
THOP1P52888 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
THOP1P52888 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
THOP1P52888 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
THOP1P52888 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
THOP1P52888 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
THOP1P52888 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
THOP1P52888 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
THOP1P52888 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
THOP1P52888 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
THOP1P52888 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
THOP1P52888 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
THOP1P52888 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
THOP1P52888 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
THOP1P52888 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
THOP1P52888 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
THOP1P52888 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
THOP1P52888 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
THOP1P52888 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
THOP1P52888 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
THOP1P52888 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
THOP1P52888 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
THOP1P52888 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
THOP1P52888 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms