Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA3P52797 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA3P52797 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms