Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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RAB5CP51148 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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RAB5CP51148 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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RAB5CP51148 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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RAB5CP51148 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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RAB5CP51148 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB5CP51148 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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