Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTPAP49638 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTPAP49638 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TTPAP49638 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTPAP49638 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTPAP49638 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TTPAP49638 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTPAP49638 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTPAP49638 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTPAP49638 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTPAP49638 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TTPAP49638 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TTPAP49638 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TTPAP49638 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTPAP49638 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTPAP49638 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTPAP49638 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTPAP49638 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTPAP49638 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTPAP49638 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTPAP49638 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTPAP49638 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTPAP49638 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTPAP49638 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTPAP49638 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTPAP49638 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTPAP49638 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTPAP49638 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTPAP49638 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTPAP49638 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTPAP49638 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTPAP49638 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTPAP49638 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTPAP49638 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TTPAP49638 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTPAP49638 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTPAP49638 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTPAP49638 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTPAP49638 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTPAP49638 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTPAP49638 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTPAP49638 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTPAP49638 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTPAP49638 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTPAP49638 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTPAP49638 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTPAP49638 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTPAP49638 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTPAP49638 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTPAP49638 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTPAP49638 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTPAP49638 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTPAP49638 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTPAP49638 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTPAP49638 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTPAP49638 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTPAP49638 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTPAP49638 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TTPAP49638 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTPAP49638 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTPAP49638 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTPAP49638 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TTPAP49638 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TTPAP49638 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTPAP49638 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTPAP49638 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTPAP49638 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTPAP49638 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTPAP49638 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTPAP49638 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTPAP49638 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTPAP49638 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTPAP49638 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TTPAP49638 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTPAP49638 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTPAP49638 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTPAP49638 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTPAP49638 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTPAP49638 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTPAP49638 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TTPAP49638 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTPAP49638 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTPAP49638 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTPAP49638 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTPAP49638 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTPAP49638 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTPAP49638 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTPAP49638 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTPAP49638 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTPAP49638 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TTPAP49638 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTPAP49638 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTPAP49638 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTPAP49638 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTPAP49638 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTPAP49638 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTPAP49638 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTPAP49638 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTPAP49638 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTPAP49638 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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