Protein–RNA interactions for Protein: P49411

TUFM, Elongation factor Tu, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFMP49411 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TUFMP49411 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TUFMP49411 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUFMP49411 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUFMP49411 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUFMP49411 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TUFMP49411 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUFMP49411 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUFMP49411 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUFMP49411 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUFMP49411 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUFMP49411 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUFMP49411 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUFMP49411 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUFMP49411 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUFMP49411 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUFMP49411 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUFMP49411 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUFMP49411 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUFMP49411 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUFMP49411 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUFMP49411 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUFMP49411 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUFMP49411 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUFMP49411 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TUFMP49411 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUFMP49411 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUFMP49411 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUFMP49411 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUFMP49411 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUFMP49411 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUFMP49411 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUFMP49411 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUFMP49411 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUFMP49411 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUFMP49411 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUFMP49411 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUFMP49411 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUFMP49411 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUFMP49411 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUFMP49411 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUFMP49411 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUFMP49411 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TUFMP49411 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TUFMP49411 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUFMP49411 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TUFMP49411 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUFMP49411 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUFMP49411 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUFMP49411 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUFMP49411 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUFMP49411 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUFMP49411 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUFMP49411 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUFMP49411 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUFMP49411 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUFMP49411 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUFMP49411 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUFMP49411 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUFMP49411 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUFMP49411 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUFMP49411 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUFMP49411 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUFMP49411 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUFMP49411 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUFMP49411 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUFMP49411 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUFMP49411 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUFMP49411 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUFMP49411 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUFMP49411 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUFMP49411 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUFMP49411 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUFMP49411 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUFMP49411 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUFMP49411 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUFMP49411 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUFMP49411 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TUFMP49411 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUFMP49411 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUFMP49411 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUFMP49411 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUFMP49411 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUFMP49411 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUFMP49411 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUFMP49411 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUFMP49411 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUFMP49411 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUFMP49411 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUFMP49411 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUFMP49411 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUFMP49411 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TUFMP49411 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TUFMP49411 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUFMP49411 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUFMP49411 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TUFMP49411 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUFMP49411 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUFMP49411 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUFMP49411 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.2 ms