Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTAP49354 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTAP49354 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTAP49354 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTAP49354 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTAP49354 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTAP49354 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTAP49354 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTAP49354 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTAP49354 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTAP49354 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FNTAP49354 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTAP49354 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTAP49354 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTAP49354 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTAP49354 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTAP49354 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTAP49354 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTAP49354 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTAP49354 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTAP49354 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTAP49354 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTAP49354 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTAP49354 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTAP49354 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTAP49354 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTAP49354 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTAP49354 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTAP49354 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTAP49354 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTAP49354 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTAP49354 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTAP49354 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTAP49354 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTAP49354 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTAP49354 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTAP49354 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTAP49354 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTAP49354 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FNTAP49354 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FNTAP49354 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FNTAP49354 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FNTAP49354 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FNTAP49354 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FNTAP49354 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FNTAP49354 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FNTAP49354 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTAP49354 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTAP49354 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTAP49354 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTAP49354 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTAP49354 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTAP49354 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTAP49354 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTAP49354 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTAP49354 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTAP49354 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTAP49354 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTAP49354 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTAP49354 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTAP49354 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTAP49354 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTAP49354 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTAP49354 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTAP49354 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTAP49354 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTAP49354 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTAP49354 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTAP49354 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTAP49354 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTAP49354 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTAP49354 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTAP49354 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTAP49354 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTAP49354 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTAP49354 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTAP49354 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTAP49354 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTAP49354 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTAP49354 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FNTAP49354 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNTAP49354 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNTAP49354 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FNTAP49354 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FNTAP49354 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNTAP49354 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FNTAP49354 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNTAP49354 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FNTAP49354 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNTAP49354 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNTAP49354 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FNTAP49354 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNTAP49354 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FNTAP49354 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNTAP49354 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNTAP49354 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FNTAP49354 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FNTAP49354 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FNTAP49354 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FNTAP49354 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms