Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NESP48681 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NESP48681 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NESP48681 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NESP48681 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NESP48681 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NESP48681 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NESP48681 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NESP48681 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NESP48681 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NESP48681 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NESP48681 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NESP48681 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NESP48681 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NESP48681 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NESP48681 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NESP48681 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NESP48681 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NESP48681 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NESP48681 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NESP48681 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NESP48681 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NESP48681 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NESP48681 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NESP48681 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NESP48681 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NESP48681 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NESP48681 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NESP48681 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NESP48681 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NESP48681 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NESP48681 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NESP48681 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NESP48681 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NESP48681 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NESP48681 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NESP48681 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NESP48681 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NESP48681 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NESP48681 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NESP48681 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NESP48681 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NESP48681 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NESP48681 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NESP48681 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NESP48681 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NESP48681 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NESP48681 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NESP48681 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NESP48681 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NESP48681 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NESP48681 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NESP48681 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NESP48681 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NESP48681 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NESP48681 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NESP48681 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NESP48681 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NESP48681 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NESP48681 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NESP48681 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NESP48681 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NESP48681 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NESP48681 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NESP48681 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NESP48681 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NESP48681 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NESP48681 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NESP48681 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NESP48681 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NESP48681 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NESP48681 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NESP48681 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NESP48681 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NESP48681 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NESP48681 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NESP48681 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NESP48681 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NESP48681 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NESP48681 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
NESP48681 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NESP48681 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NESP48681 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NESP48681 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NESP48681 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
NESP48681 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NESP48681 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NESP48681 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NESP48681 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NESP48681 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NESP48681 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NESP48681 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NESP48681 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NESP48681 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NESP48681 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NESP48681 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NESP48681 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NESP48681 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NESP48681 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NESP48681 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms