Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GNPDA1P46926 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms