Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSG1P42857 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSG1P42857 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSG1P42857 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NSG1P42857 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSG1P42857 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSG1P42857 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSG1P42857 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NSG1P42857 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSG1P42857 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NSG1P42857 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSG1P42857 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSG1P42857 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSG1P42857 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSG1P42857 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSG1P42857 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSG1P42857 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSG1P42857 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSG1P42857 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSG1P42857 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSG1P42857 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NSG1P42857 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSG1P42857 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSG1P42857 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSG1P42857 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSG1P42857 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSG1P42857 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSG1P42857 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSG1P42857 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSG1P42857 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSG1P42857 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSG1P42857 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSG1P42857 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSG1P42857 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSG1P42857 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSG1P42857 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSG1P42857 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSG1P42857 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSG1P42857 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSG1P42857 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSG1P42857 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSG1P42857 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSG1P42857 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSG1P42857 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NSG1P42857 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NSG1P42857 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NSG1P42857 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSG1P42857 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSG1P42857 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSG1P42857 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSG1P42857 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSG1P42857 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSG1P42857 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NSG1P42857 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSG1P42857 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSG1P42857 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSG1P42857 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NSG1P42857 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSG1P42857 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSG1P42857 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSG1P42857 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSG1P42857 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSG1P42857 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSG1P42857 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSG1P42857 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSG1P42857 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSG1P42857 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSG1P42857 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSG1P42857 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSG1P42857 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSG1P42857 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSG1P42857 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSG1P42857 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSG1P42857 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSG1P42857 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSG1P42857 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NSG1P42857 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSG1P42857 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSG1P42857 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSG1P42857 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSG1P42857 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSG1P42857 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSG1P42857 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSG1P42857 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSG1P42857 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSG1P42857 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSG1P42857 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSG1P42857 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NSG1P42857 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NSG1P42857 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSG1P42857 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSG1P42857 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSG1P42857 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NSG1P42857 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSG1P42857 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSG1P42857 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSG1P42857 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NSG1P42857 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSG1P42857 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NSG1P42857 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms