Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPHP41219 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPHP41219 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPHP41219 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPHP41219 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPHP41219 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPHP41219 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPHP41219 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPHP41219 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPHP41219 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPHP41219 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPHP41219 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPHP41219 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPHP41219 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPHP41219 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPHP41219 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPHP41219 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPHP41219 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPHP41219 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPHP41219 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPHP41219 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPHP41219 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPHP41219 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPHP41219 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPHP41219 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPHP41219 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPHP41219 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPHP41219 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPHP41219 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPHP41219 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPHP41219 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPHP41219 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPHP41219 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPHP41219 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPHP41219 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPHP41219 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPHP41219 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPHP41219 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPHP41219 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPHP41219 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPHP41219 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPHP41219 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPHP41219 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPHP41219 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPHP41219 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPHP41219 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPHP41219 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPHP41219 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPHP41219 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPHP41219 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPHP41219 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPHP41219 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPHP41219 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPHP41219 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPHP41219 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPHP41219 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPHP41219 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPHP41219 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPHP41219 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPHP41219 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPHP41219 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPHP41219 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPHP41219 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPHP41219 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPHP41219 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPHP41219 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPHP41219 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPHP41219 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPHP41219 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPHP41219 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPHP41219 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPHP41219 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPHP41219 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPHP41219 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPHP41219 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPHP41219 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPHP41219 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPHP41219 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPHP41219 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPHP41219 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPHP41219 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPHP41219 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPHP41219 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPHP41219 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPHP41219 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPHP41219 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPHP41219 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPHP41219 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPHP41219 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPHP41219 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPHP41219 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPHP41219 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPHP41219 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPHP41219 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPHP41219 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPHP41219 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPHP41219 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPHP41219 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPHP41219 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PRPHP41219 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms