Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBX2P40425 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBX2P40425 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBX2P40425 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBX2P40425 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBX2P40425 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBX2P40425 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBX2P40425 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBX2P40425 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBX2P40425 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PBX2P40425 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PBX2P40425 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBX2P40425 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBX2P40425 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBX2P40425 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBX2P40425 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBX2P40425 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBX2P40425 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBX2P40425 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBX2P40425 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBX2P40425 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBX2P40425 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBX2P40425 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBX2P40425 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBX2P40425 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PBX2P40425 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBX2P40425 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBX2P40425 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBX2P40425 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBX2P40425 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBX2P40425 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBX2P40425 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBX2P40425 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBX2P40425 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBX2P40425 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBX2P40425 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBX2P40425 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBX2P40425 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBX2P40425 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBX2P40425 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBX2P40425 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PBX2P40425 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PBX2P40425 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PBX2P40425 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PBX2P40425 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PBX2P40425 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PBX2P40425 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PBX2P40425 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PBX2P40425 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PBX2P40425 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PBX2P40425 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PBX2P40425 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PBX2P40425 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PBX2P40425 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PBX2P40425 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PBX2P40425 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PBX2P40425 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PBX2P40425 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PBX2P40425 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PBX2P40425 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PBX2P40425 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PBX2P40425 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PBX2P40425 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PBX2P40425 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PBX2P40425 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PBX2P40425 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PBX2P40425 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PBX2P40425 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PBX2P40425 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PBX2P40425 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PBX2P40425 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PBX2P40425 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PBX2P40425 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PBX2P40425 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PBX2P40425 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PBX2P40425 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PBX2P40425 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PBX2P40425 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PBX2P40425 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PBX2P40425 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PBX2P40425 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PBX2P40425 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PBX2P40425 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PBX2P40425 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PBX2P40425 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PBX2P40425 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PBX2P40425 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PBX2P40425 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PBX2P40425 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PBX2P40425 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PBX2P40425 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PBX2P40425 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PBX2P40425 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PBX2P40425 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PBX2P40425 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PBX2P40425 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PBX2P40425 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PBX2P40425 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PBX2P40425 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PBX2P40425 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms