Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHRNA7P36544 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms