Protein–RNA interactions for Protein: P35321

SPRR1A, Cornifin-A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1AP35321 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms