Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2H1P32780 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2H1P32780 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2H1P32780 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2H1P32780 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2H1P32780 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2H1P32780 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2H1P32780 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2H1P32780 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2H1P32780 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2H1P32780 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2H1P32780 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2H1P32780 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2H1P32780 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2H1P32780 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2H1P32780 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2H1P32780 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2H1P32780 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2H1P32780 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2H1P32780 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2H1P32780 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2H1P32780 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2H1P32780 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2H1P32780 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2H1P32780 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2H1P32780 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2H1P32780 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2H1P32780 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2H1P32780 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2H1P32780 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H1P32780 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms