Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HOXC13P31276 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC13P31276 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms