Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TSPOP30536 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TSPOP30536 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TSPOP30536 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TSPOP30536 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TSPOP30536 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TSPOP30536 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TSPOP30536 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TSPOP30536 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TSPOP30536 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TSPOP30536 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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