Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GTF2E2P29084 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms