Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCD3P28288 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCD3P28288 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCD3P28288 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCD3P28288 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCD3P28288 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCD3P28288 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCD3P28288 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ABCD3P28288 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCD3P28288 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCD3P28288 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCD3P28288 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCD3P28288 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCD3P28288 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCD3P28288 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCD3P28288 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCD3P28288 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCD3P28288 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCD3P28288 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCD3P28288 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCD3P28288 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCD3P28288 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCD3P28288 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCD3P28288 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCD3P28288 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCD3P28288 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCD3P28288 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCD3P28288 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCD3P28288 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCD3P28288 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ABCD3P28288 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCD3P28288 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ABCD3P28288 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCD3P28288 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCD3P28288 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCD3P28288 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ABCD3P28288 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCD3P28288 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCD3P28288 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ABCD3P28288 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCD3P28288 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCD3P28288 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCD3P28288 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCD3P28288 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCD3P28288 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCD3P28288 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCD3P28288 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCD3P28288 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCD3P28288 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCD3P28288 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCD3P28288 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCD3P28288 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCD3P28288 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCD3P28288 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCD3P28288 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCD3P28288 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCD3P28288 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ABCD3P28288 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ABCD3P28288 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ABCD3P28288 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ABCD3P28288 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ABCD3P28288 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ABCD3P28288 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ABCD3P28288 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ABCD3P28288 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ABCD3P28288 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ABCD3P28288 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ABCD3P28288 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ABCD3P28288 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ABCD3P28288 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCD3P28288 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCD3P28288 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCD3P28288 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCD3P28288 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ABCD3P28288 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCD3P28288 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCD3P28288 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABCD3P28288 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABCD3P28288 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ABCD3P28288 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCD3P28288 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCD3P28288 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCD3P28288 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCD3P28288 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABCD3P28288 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCD3P28288 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCD3P28288 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ABCD3P28288 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ABCD3P28288 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABCD3P28288 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABCD3P28288 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCD3P28288 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCD3P28288 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCD3P28288 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABCD3P28288 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABCD3P28288 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCD3P28288 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABCD3P28288 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABCD3P28288 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCD3P28288 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms