Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PSMB4P28070 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB4P28070 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms