Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTX3P26022 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTX3P26022 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTX3P26022 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTX3P26022 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTX3P26022 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTX3P26022 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTX3P26022 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTX3P26022 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTX3P26022 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTX3P26022 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTX3P26022 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTX3P26022 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTX3P26022 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTX3P26022 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTX3P26022 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTX3P26022 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTX3P26022 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTX3P26022 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTX3P26022 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTX3P26022 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTX3P26022 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTX3P26022 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTX3P26022 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTX3P26022 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTX3P26022 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTX3P26022 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTX3P26022 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTX3P26022 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTX3P26022 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTX3P26022 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTX3P26022 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTX3P26022 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTX3P26022 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTX3P26022 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTX3P26022 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTX3P26022 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTX3P26022 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTX3P26022 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTX3P26022 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTX3P26022 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTX3P26022 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTX3P26022 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTX3P26022 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTX3P26022 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTX3P26022 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTX3P26022 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTX3P26022 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTX3P26022 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTX3P26022 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTX3P26022 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTX3P26022 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
PTX3P26022 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTX3P26022 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTX3P26022 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTX3P26022 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTX3P26022 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTX3P26022 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTX3P26022 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTX3P26022 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTX3P26022 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTX3P26022 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTX3P26022 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTX3P26022 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTX3P26022 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTX3P26022 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTX3P26022 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTX3P26022 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTX3P26022 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PTX3P26022 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTX3P26022 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTX3P26022 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PTX3P26022 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PTX3P26022 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTX3P26022 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTX3P26022 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTX3P26022 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTX3P26022 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PTX3P26022 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTX3P26022 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTX3P26022 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTX3P26022 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTX3P26022 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTX3P26022 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTX3P26022 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTX3P26022 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTX3P26022 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTX3P26022 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTX3P26022 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTX3P26022 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTX3P26022 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTX3P26022 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTX3P26022 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTX3P26022 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTX3P26022 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTX3P26022 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTX3P26022 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTX3P26022 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTX3P26022 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTX3P26022 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms