Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCHP24723 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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