Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TNNI3P19429 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms