Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LIG1P18858 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LIG1P18858 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LIG1P18858 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LIG1P18858 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LIG1P18858 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LIG1P18858 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LIG1P18858 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LIG1P18858 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LIG1P18858 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LIG1P18858 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LIG1P18858 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LIG1P18858 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LIG1P18858 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LIG1P18858 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LIG1P18858 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LIG1P18858 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LIG1P18858 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LIG1P18858 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LIG1P18858 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LIG1P18858 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LIG1P18858 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LIG1P18858 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LIG1P18858 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LIG1P18858 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LIG1P18858 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LIG1P18858 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LIG1P18858 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LIG1P18858 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIG1P18858 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIG1P18858 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIG1P18858 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LIG1P18858 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIG1P18858 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIG1P18858 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIG1P18858 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIG1P18858 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIG1P18858 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIG1P18858 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIG1P18858 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIG1P18858 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIG1P18858 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIG1P18858 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIG1P18858 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIG1P18858 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIG1P18858 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LIG1P18858 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIG1P18858 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIG1P18858 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIG1P18858 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIG1P18858 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIG1P18858 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIG1P18858 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIG1P18858 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIG1P18858 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIG1P18858 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIG1P18858 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIG1P18858 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIG1P18858 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIG1P18858 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIG1P18858 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIG1P18858 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIG1P18858 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIG1P18858 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIG1P18858 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIG1P18858 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIG1P18858 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIG1P18858 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIG1P18858 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIG1P18858 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIG1P18858 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LIG1P18858 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LIG1P18858 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LIG1P18858 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LIG1P18858 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LIG1P18858 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LIG1P18858 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LIG1P18858 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LIG1P18858 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LIG1P18858 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LIG1P18858 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LIG1P18858 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LIG1P18858 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LIG1P18858 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LIG1P18858 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LIG1P18858 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LIG1P18858 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LIG1P18858 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LIG1P18858 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LIG1P18858 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LIG1P18858 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LIG1P18858 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LIG1P18858 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LIG1P18858 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LIG1P18858 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LIG1P18858 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LIG1P18858 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LIG1P18858 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LIG1P18858 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LIG1P18858 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms